Scaderea limfocitelor, numita limfopenie (<1000/µL) poate avea urmatoarrele cauze:
Imunodeficiente congenitale: sindroame de imunodeficienta combinata.
Infectia HIV (scaderea selectiva a celulelor CD4+).
Chimioterapia, radioterapia, medicatia imunosupresoare.
Lupus eritematos sistemic (sunt prezenti anticorpi anti-limfocitari care produc liza complement mediata a limfocitelor); boala mixta de tesut conjuctiv; dermatomiozita.
Tuberculoza avansata (miliara): scaderea marcata a celulelor CD4+, Virusul gripal (limfopenia apare tipic dupa rezolvarea infectiei).
Boala Hodgkin si alte malignitati,  Anemia aplastica.
Administrarea de ACTH/corticosteroizi; tumori hipofizare secretoare de ACTH; boala Cushing.
Pierderi crescute la nivelul tractului intestinal prin obstructia drenajului limfatic: tumori, boala Whipple, limfangiectazie intestinala; boli inflamatorii intestinale.
Uremia.
Diverse: sarcoidoza, insuficienta cardiaca congestiva, boli debilitante severe, muscaturi de sarpe, arsuri, anestezie, proceduri chirurgicale, by-pass cardiopulmonar.

Cresterea numarului de limfocite, numita limfocitoza (>4000/µL)poate avea diverse cauze:
 Limfocitoza infectioasa (apare in special la copii), Mononucleoza infectioasa, infectii virale ale tractului respirator superior, infectii cu citomegalovirus, rujeola, oreion, varicela, hepatita acuta virala, infectie acuta cu HIV, infectii cronice (tuberculoza, sifilis), tuse convulsiva, toxoplasmoza, febra tifoida, bruceloza, limfocitoza infectioasa, mononucleoza infectioasa, tusea convulsiva, Boala Crohn, colita ulcerativa, Boala Addison, Boala serului, hipersensibitate medicamentoasa, Vasculite, Limfocitoza policlonala persistenta (conditie benigna rara, care afecteaza tipic femei  fumatoare de varsta mijlocie, cu tendinta familiala, cu prezenta de limfocite binucleate cu citoplasma abundenta), Sindromul de splenomegalie hiperreactiva din malarie.

Cauzele maligne ale limfocitozei pot fi:
Leucemia limfocitara cronica, leucemia prolimfocitara cu celula B, leucemia cu celule paroase, faza leucemica din limfoamele nonhodgkin, macroglobulinemia Waldenström, Leucemia prolimfocitara cu celula T, leucemia/limfomul cu celula T al adultului, sindromul Sézary, leucemia cu limfocite mari granulare.